胞間CO2濃度(Ci)是光合生態研究中經常用到的一個參數，特別是光合作用的氣孔限制分析中，胞間CO2濃度的變化方向是確定光合速率變化的主要原因和是否為氣孔因素的重要判斷依據。可是，這種計算的胞間CO2濃度值僅僅在葉片上全部氣孔的開放或關閉行為均勻一致下才是正確的。
按照光合學，胞間二氧化碳濃度Ci(μmol)是CO2同化速率與氣孔導度的比值。
實際上，胞間CO2濃度的大小取決于4個可能變化的因素：葉片周圍空氣的CO2濃度、氣孔導度(Gs)、葉肉導度(gm)和葉肉細胞的光合活性。
氣孔導度(Gs):表示的是氣孔張開的程度。
葉肉導度(gm)：CO2從氣孔下腔傳輸到羧化位點的阻力稱為葉肉阻力，其倒數即為葉肉導度。
空氣中的CO2濃度增高、氣孔導度、葉肉導度增大和葉肉細胞的光合活性降低都可以導致胞間CO2濃度的增高；而空氣的CO2濃度降低、氣孔導度與葉肉導度減小和葉肉細胞的光合活性提高也均會導致胞間CO2濃度的降低。當空氣的CO2濃度恒定不變時，胞間CO2濃度變化是氣孔導度、葉肉導度和葉肉細胞光合活性變化的代數和。
一般情況下，胞間CO2濃度(Ci)和凈光合作用的關系呈正相關，胞間CO2濃度越高，光合速率越低；胞間CO2濃度較高時，光合速率下降趨勢平緩；當胞間CO2濃度降至較低水平后，光合速率下降幅度明顯，甚至出現直線相關性。這種正相關說明，光合速率的增高是胞間CO2濃度增高的結果，是兩者關系的規律性反映。
也有文獻中提到，光合速率和胞間二氧化碳濃度之間呈負相關或無相關，因為胞間CO2濃度還涉及到許多因素，所以，我們不能簡簡單單認為胞間CO2濃度就代表了凈光合速率。